La Dirección de Administración de Educación Municipal (DAEM) se encarga de la gestión de los establecimientos educacionales municipales de la comuna. Lo cual incluye a las escuelas básicas, liceos y jardines infantiles.
La Dirección Comunal de Educación de Mulchén, comprende 22 establecimientos y 5 jardines infantiles con oferta en educación inicial, enseñanza básica, media, educación para adultos y especial.